General
Installation
API
Classes
livecellx.core.SingleCellStatic
livecellx.core.SingleCellTrajectory
livecellx.core.SingleCellTrajectoryCollection
SingleCellTrajectoryCollection
livecellx.core.SingleCellTrajectoryCollection.add_trajectory
livecellx.core.SingleCellTrajectoryCollection.filter_trajectories
livecellx.core.SingleCellTrajectoryCollection.filter_trajectories_by_length
livecellx.core.SingleCellTrajectoryCollection.get_all_scs
livecellx.core.SingleCellTrajectoryCollection.get_all_tids
livecellx.core.SingleCellTrajectoryCollection.get_all_track_ids
livecellx.core.SingleCellTrajectoryCollection.get_all_trajectories
livecellx.core.SingleCellTrajectoryCollection.get_feature_table
livecellx.core.SingleCellTrajectoryCollection.get_max_tid
livecellx.core.SingleCellTrajectoryCollection.get_time_span
livecellx.core.SingleCellTrajectoryCollection.get_track_ids
livecellx.core.SingleCellTrajectoryCollection.get_trajectory
livecellx.core.SingleCellTrajectoryCollection.histogram_traj_length
livecellx.core.SingleCellTrajectoryCollection.load_from_json_dict
livecellx.core.SingleCellTrajectoryCollection.load_from_json_dict_parallel
livecellx.core.SingleCellTrajectoryCollection.load_from_json_file
livecellx.core.SingleCellTrajectoryCollection.pop_trajectory
livecellx.core.SingleCellTrajectoryCollection.remove_empty_sct
livecellx.core.SingleCellTrajectoryCollection.show_tracks
livecellx.core.SingleCellTrajectoryCollection.subset
livecellx.core.SingleCellTrajectoryCollection.subset_random
livecellx.core.SingleCellTrajectoryCollection.to_json_dict
livecellx.core.SingleCellTrajectoryCollection.write_json
SingleCellTrajectoryCollection.write_json()
livecellx.core.datasets.LiveCellImageDataset
livecellx.core.datasets.SingleImageDataset
livecellx.core.io_utils.LiveCellEncoder
livecellx.core.napari_visualizer.NapariVisualizer
livecellx.core.sc_key_manager.SingleCellMetaKeyManager
livecellx.core.sc_seg_operator.ScSegOperator
livecellx.core.sct_operator.SctOperator
Quick Start Guide
Gallery
Livecellx Tutorials
livecellx
Classes
livecellx.core.SingleCellTrajectoryCollection
livecellx.core.SingleCellTrajectoryCollection.write_json
Edit on GitHub
livecellx.core.SingleCellTrajectoryCollection.write_json
SingleCellTrajectoryCollection.
write_json
(
path
,
dataset_json_dir
=
None
,
filter_empty
=
True
)
[source]