General
Installation
API
Classes
livecellx.core.SingleCellStatic
livecellx.core.SingleCellTrajectory
SingleCellTrajectory
livecellx.core.SingleCellTrajectory.add_daughter
livecellx.core.SingleCellTrajectory.add_mother
livecellx.core.SingleCellTrajectory.add_nonoverlapping_sct
livecellx.core.SingleCellTrajectory.add_sc
livecellx.core.SingleCellTrajectory.add_single_cell
livecellx.core.SingleCellTrajectory.compute_features
livecellx.core.SingleCellTrajectory.copy
livecellx.core.SingleCellTrajectory.get_all_scs
livecellx.core.SingleCellTrajectory.get_img
livecellx.core.SingleCellTrajectory.get_mask
livecellx.core.SingleCellTrajectory.get_prev_by_sc
livecellx.core.SingleCellTrajectory.get_sc_bboxes
livecellx.core.SingleCellTrajectory.get_sc_feature_table
livecellx.core.SingleCellTrajectory.get_scs_napari_shapes
SingleCellTrajectory.get_scs_napari_shapes()
livecellx.core.SingleCellTrajectory.get_single_cell
livecellx.core.SingleCellTrajectory.get_sorted_scs
livecellx.core.SingleCellTrajectory.get_time_span
livecellx.core.SingleCellTrajectory.get_time_span_length
livecellx.core.SingleCellTrajectory.get_timeframe_span
livecellx.core.SingleCellTrajectory.get_timeframe_span_length
livecellx.core.SingleCellTrajectory.inflate_other_trajectories
livecellx.core.SingleCellTrajectory.inflate_other_trajectories_by_dict
livecellx.core.SingleCellTrajectory.is_empty
livecellx.core.SingleCellTrajectory.load_from_json_dict
livecellx.core.SingleCellTrajectory.load_from_json_file
livecellx.core.SingleCellTrajectory.next_time
livecellx.core.SingleCellTrajectory.num_scs
livecellx.core.SingleCellTrajectory.pop_single_cell
livecellx.core.SingleCellTrajectory.remove_daughter
livecellx.core.SingleCellTrajectory.remove_mother
livecellx.core.SingleCellTrajectory.show_on_grid
livecellx.core.SingleCellTrajectory.show_trajectory_on_grid
livecellx.core.SingleCellTrajectory.split
livecellx.core.SingleCellTrajectory.subsct
livecellx.core.SingleCellTrajectory.to_json_dict
livecellx.core.SingleCellTrajectory.write_json
livecellx.core.SingleCellTrajectory.META_DAUGHTER_IDS
livecellx.core.SingleCellTrajectory.META_MOTHER_IDS
livecellx.core.SingleCellTrajectoryCollection
livecellx.core.datasets.LiveCellImageDataset
livecellx.core.datasets.SingleImageDataset
livecellx.core.io_utils.LiveCellEncoder
livecellx.core.napari_visualizer.NapariVisualizer
livecellx.core.sc_key_manager.SingleCellMetaKeyManager
livecellx.core.sc_seg_operator.ScSegOperator
livecellx.core.sct_operator.SctOperator
Quick Start Guide
Gallery
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livecellx
Classes
livecellx.core.SingleCellTrajectory
livecellx.core.SingleCellTrajectory.get_scs_napari_shapes
Edit on GitHub
livecellx.core.SingleCellTrajectory.get_scs_napari_shapes
SingleCellTrajectory.
get_scs_napari_shapes
(
bbox
=
False
,
contour_sample_num
=
20
,
return_scs
=
False
)
[source]